Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMX1Q9NP08 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HMX1Q9NP08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMX1Q9NP08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMX1Q9NP08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMX1Q9NP08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HMX1Q9NP08 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms