Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TXNRD2Q9NNW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD2Q9NNW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNRD2Q9NNW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNRD2Q9NNW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms