Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C6orf50Q9HD87 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C6orf50Q9HD87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf50Q9HD87 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms