Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF556Q9HAH1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF556Q9HAH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF556Q9HAH1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms