Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPERBQ9H7T0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPERBQ9H7T0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPERBQ9H7T0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms