Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TDRD3Q9H7E2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TDRD3Q9H7E2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TDRD3Q9H7E2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TDRD3Q9H7E2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TDRD3Q9H7E2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms