Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPF2Q9H7B2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPF2Q9H7B2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms