Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf49Q9H6J7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms