Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX3Q9H6A9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX3Q9H6A9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms