Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB6CQ9H0N0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ9H0N0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ9H0N0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ9H0N0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms