Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HAPLN2Q9GZV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HAPLN2Q9GZV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HAPLN2Q9GZV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HAPLN2Q9GZV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms