Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT23Q9C075 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT23Q9C075 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT23Q9C075 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT23Q9C075 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms