Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRIP1Q9BX63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
BRIP1Q9BX63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRIP1Q9BX63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms