Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM246Q9BRR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM246Q9BRR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms