Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC77Q9BR77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC77Q9BR77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms