Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LPIN3Q9BQK8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPIN3Q9BQK8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms