Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF25Q9BQ70 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF25Q9BQ70 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms