Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMD1Q99460 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMD1Q99460 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMD1Q99460 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms