Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UHRF1Q96T88 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UHRF1Q96T88 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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