Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPENQ96T58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SPENQ96T58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms