Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL7Q96S82 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBL7Q96S82 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL7Q96S82 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms