Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CSRNP1Q96S65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP1Q96S65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP1Q96S65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSRNP1Q96S65 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP1Q96S65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms