Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP5Q96RT8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP5Q96RT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms