Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX3Q96QZ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PANX3Q96QZ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PANX3Q96QZ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PANX3Q96QZ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms