Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAM1Q96QH2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PRAM1Q96QH2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAM1Q96QH2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAM1Q96QH2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms