Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH12Q96NR8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH12Q96NR8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms