Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOX2Q96NM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOX2Q96NM4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOX2Q96NM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms