Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC1Q96MU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC1Q96MU7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
YTHDC1Q96MU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
YTHDC1Q96MU7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms