Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF145Q96MT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF145Q96MT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF145Q96MT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms