Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP57Q96MR6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP57Q96MR6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP57Q96MR6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms