Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL15Q96M94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL15Q96M94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms