Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHDQ96IW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SHDQ96IW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms