Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEIL1Q96FI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms