Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO17Q96EF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO17Q96EF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO17Q96EF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms