Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPACA9Q96E40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPACA9Q96E40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms