Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXorf40BQ96DE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXorf40BQ96DE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXorf40BQ96DE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms