Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4CQ96CF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHMP4CQ96CF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms