Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2E3Q969T4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms