Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GJA10Q969M2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA10Q969M2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA10Q969M2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA10Q969M2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJA10Q969M2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA10Q969M2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA10Q969M2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA10Q969M2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA10Q969M2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA10Q969M2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA10Q969M2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GJA10Q969M2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA10Q969M2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms