Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A4Q969I6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms