Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3Q969G5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN3Q969G5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN3Q969G5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms