Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP9XQ93008 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP9XQ93008 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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