Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX13Q92968 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX13Q92968 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms