Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF4BQ92750 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF4BQ92750 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF4BQ92750 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF4BQ92750 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms