Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL1Q8WXF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL1Q8WXF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms