Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE2Q8WWL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPIRE2Q8WWL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE2Q8WWL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE2Q8WWL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms