Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF138Q8WVD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF138Q8WVD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF138Q8WVD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF138Q8WVD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms