Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L4Q8WU68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2AF1L4Q8WU68 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2AF1L4Q8WU68 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2AF1L4Q8WU68 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms