Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGR3Q8TD06 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGR3Q8TD06 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGR3Q8TD06 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms