Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBP-AS1Q8TBR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms